90話以前｜91-95｜96-100｜101-105｜106-110｜111-115｜116-120｜121話以降
※注 ★・・・CD収録曲 未・・・CD未収録曲
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| AG96話「筋肉バトル！？ダブルバトル!!」 | ||||||
| 曲順 | 曲名 | カントー | 金銀 | AG | 映画 | シーン等 |
| Aパート | ||||||
| 1 | 金銀・未収録 | 未 | 謎の声を聞くサトシ達 | |||
| 2 | ピカ夏の曲（１回目） | 未 | ロケット団が潜水艦を波にさらわれて沈没してしまう | |||
| 3 | ＡＧ・未収録 | 未 | 体を鍛えるイワシミズの一団に出会うサトシ達 | |||
| 4 | 運動会ＣＤ「金銀・29番道路」 | ★ | イマシミズに旅の話を聞かせてくれと言われる | |||
| 5 | サントラ「ロケット団隠密作戦」（１回目） | ★ | ニャースのボス妄想 | |||
| 6 | カントー・未収録 | 未 | トレーニングをして体力をつけようと燃えるコジロウ | |||
| 7 | カントー・未収録 | 未 | トレーニングを体験するサトシ達 | |||
| 8 | ＡＧ・未収録 | 未 | トレーニングに励むロケット団を見つけるサトシ達 | |||
| 9 | 金銀・未収録〔26,27番道路〕 | 未 | イワシミズとポケモンバトルをしようと誘われるサトシ | |||
| 10 | ピカ夏の曲（２回目） | 未 | 目的も忘れトレーニングに励むロケット団 | |||
| 11 | ＡＧ・未収録〔アクア・マグマ団〕 | 未 | イワシミズとダブルバトルをするサトシ | |||
| 12 | ルギア・未収録 | 未 | ピカチュウの電撃攻撃をヌオーに防がれる | |||
| Bパート | ||||||
| 13 | 金銀・未収録 | 未 | トレーニングをするハルカ達とムサシ達 | |||
| 14 | カントー・未収録 | 未 | バトルを続けるサトシとイワシミズ | |||
| 15 | 結晶塔・未収録 | 未 | サトシを挑発するイワシミズ | |||
| 16 | ミュウツー「強者ミュウツー」 | ★ | イワシミズのポケモンに苦戦するサトシ | |||
| 17 | ？？（セレビィ未収録？） | 未 | トドゼルガの攻撃を見切ったサトシ | |||
| 18 | 運動会ＣＤ「ＯＰテーマ「アドバンス・アドベンチャー」INST.」 | ★ | 攻撃を見切ってイワシミズのポケモンを打ち倒したサトシ | |||
| 19 | サントラ「出会いと別れと」 | ★ | お互いの健闘を称えあう２人 | |||
| 20 | サントラ「ロケット団隠密作戦」（２回目） | ★ | 船員に化けてピカチュウ強奪を企むロケット団 | |||
| 21 | ＡＧ・収録曲「ロケット団参上！のテーマ（ホウエン・バージョン）」 | ★ | サトシ達の前に現れ口上を言うロケット団 | |||
| 22 | ひみつ基地「危機」 | ★ | ピカチュウを奪おうとするロケット団と止めようとするサトシ達 | |||
| 備考 |
| ◆使用各曲の内訳（重複は除外）。（＊の部分は未収録曲） ※「？？」は劇場版未収録としてカウント）。 ■98年のサントラ収録曲・・・２ ■ＡＧの収録曲・・・２ ■運動会ＣＤの収録曲 （金銀）・・・１ （ＡＧ）・・・１ ■サントラ未収録 （カントー）・・・２＊ （金銀）・・・４＊ （ＡＧ）・・・３＊ ■劇場版 （サントラ収録曲）・・・２ （サントラ未収録）・・・３ 【今回の不明曲】 17曲目に使われた曲（セレビィ収録曲？？） |
| AG97話「グラードンVSカイオーガ！（前編）」 | ||||||
| 曲順 | 曲名 | カントー | 金銀 | AG | 映画 | シーン等 |
| Aパート | ||||||
| 1 | ＡＧ・未収録 | 未 | 冒頭、前回までのあらすじ | |||
| 2 | ＡＧ・未収録 | 未 | マグマ団の潜水艦からホムラ登場 | |||
| 3 | ＡＧ・未収録〔アジト〕 | 未 | マグマ団員に変装したイズミがマグマ団基地に潜入 | |||
| 4 | ジラーチ・未収録〔グラードンのテーマ〕 | 未 | マツブサから超古代ポケモン・カイオーガをマグマ団が手中にしたと語る | |||
| 5 | ジラーチ・未収録 | 未 | イズミがカイオーガをマグマ団基地から解放する | |||
| 6 | 水の都・未収録 | 未 | 藍色の珠がピカチュウと融合してしまう | |||
| Bパート | ||||||
| 7 | 水の都・未収録（１回目） | 未 | アオギリが珠の力を使ってマグマ団基地を攻撃させる | |||
| 8 | ＡＧ・未収録 | 未 | マツブサとアオギリの会談 | |||
| 9 | 結晶塔・未収録 | 未 | 珠の力で暴れまわるピカチュウ | |||
| 10 | 結晶塔・未収録 | 未 | ワタルに２つの珠の事を聞かされるサトシ | |||
| 11 | 結晶塔・未収録（ロケット団隠密） | 未 | グラードンとカイオーガを奪おうとアクア団の潜水艦に近づくロケット団 | |||
| 12 | 水の都・未収録（２回目） | 未 | ロケット団がカイオーガのいるコンテナに進入する | |||
| 備考 |
| ◆使用各曲の内訳（重複は除外）。（＊の部分は未収録曲） ※「？？」は劇場版未収録としてカウント）。 ■98年のサントラ収録曲・・・０ ■ＡＧの収録曲・・・０ ■運動会ＣＤの収録曲 （金銀）・・・０ （ＡＧ）・・・０ ■サントラ未収録 （カントー）・・・０＊ （金銀）・・・０＊ （ＡＧ）・・・４＊ ■劇場版 （サントラ収録曲）・・・０ （サントラ未収録）・・・７ |
| AG98話「グラードンVSカイオーガ！（後編）」 | ||||||
| 曲順 | 曲名 | カントー | 金銀 | AG | 映画 | シーン等 |
| Aパート | ||||||
| 1 | ジラーチ・未収録 | 未 | 冒頭、前回までのあらすじ | |||
| 2 | ジラーチ・未収録 | 未 | カイオーガが海に放たれたと報告を受けるアオギリ | |||
| 3 | 水の都・未収録 | 未 | 珠の力で暴れまわるカイオーガ | |||
| 4 | 結晶塔・未収録 | 未 | 大津波が島に襲来 | |||
| 5 | サントラ「ロケット団隠密作戦」 | ★ | ニャースが変な作戦を思いつく | |||
| 6 | ジラーチ「バトラーのテーマ」 | ★ | 珠の力で暴れまわるピカチュウ登場 | |||
| Bパート | ||||||
| 7 | ジラーチ「ラストバトル！！」 | ★ | グラードンが眠りから覚め登場 | |||
| 8 | ミュウツー「サトシ戦いの決意」 | ★ | サトシがピカチュウを助ける為カイオーガ達と戦うと決意 | |||
| 9 | 水の都「出撃！」 | ★ | ハルカ達がアオギリの注意を引きつけようとポケモンを出す | |||
| 10 | 水の都・未収録 | 未 | 正気に戻ったカイオーガに助けられたサトシとピカチュウ | |||
| 備考 |
| ◆使用各曲の内訳（重複は除外）。（＊の部分は未収録曲） ※「？？」は劇場版未収録としてカウント）。 ■98年のサントラ収録曲・・・１ ■ＡＧの収録曲・・・０ ■運動会ＣＤの収録曲 （金銀）・・・０ （ＡＧ）・・・０ ■サントラ未収録 （カントー）・・・０＊ （金銀）・・・０＊ （ＡＧ）・・・０＊ ■劇場版 （サントラ収録曲）・・・４ （サントラ未収録）・・・５ |
| AG99話「フウとラン！宇宙センターの戦い！」 | ||||||
| 曲順 | 曲名 | カントー | 金銀 | AG | 映画 | シーン等 |
| Aパート | ||||||
| 1 | ？？〔サントラ「旅立ち」アレンジ〕 | 冒頭、トクサネ島に到着した一行 | ||||
| 2 | ＡＧ・未収録 | 未 | トクサネジムから出てきた女性から宇宙センターの事を聞かされる | |||
| 3 | サントラ「ロケット団隠密作戦」 | ★ | ニャースのボス妄想 | |||
| 4 | カントー・未収録 | 未 | 宇宙飛行士の訓練機器を見つけた一行 | |||
| 5 | サントラ「不屈のポケモン」 | ★ | フウとランが訓練バトルをしているのを見る | |||
| 6 | 金銀・未収録 | 未 | サトシが無重力の部屋に入ってフウとランと出会う | |||
| 7 | ルギア・未収録 | 未 | フウとランがトクサネジムリーダだとサトシに告げる | |||
| Bパート | ||||||
| 8 | サントラ「一件落着」 | ★ | 訓練機器でポケモン達を遊ばせるサトシ達 | |||
| 9 | ＡＧ・収録曲「ロケット団参上！のテーマ（ホウエン・バージョン）」 | ★ | 監視カメラに向かって口上を名乗るロケット団 | |||
| 10 | ひみつ基地「危機」 | ★ | ロケットを奪おうと乗り込もうとするロケット団と対峙するサトシ達 | |||
| 11 | ひみつ基地「ひみつ基地？〜ロケット団のテーマ〜」 | ★ | 操縦席にいたマサトとフウを縛り上げるニャース | |||
| 12 | 金銀・未収録 | 未 | ロケットを点火させて離陸するロケット団 | |||
| 13 | ＡＧ・未収録 | 未 | ヤジロンの念力でロケットを止めている | |||
| 14 | ひみつ基地「活躍！」 | ★ | ソルロックのサイコキネシスでロケット団を撃退 | |||
| 15 | ＡＧ・未収録 | 未 | 地上に帰還するためマサトとフウがロケットを操縦 | |||
| 16 | 運動会ＣＤ「ＯＰテーマ「アドバンス・アドベンチャー」INST.」 | ★ | 怒りのハルカとランがロケット団を撃退 | |||
| 17 | ミュウツー「サトシ戦いの決意」（メドレー後半） | ★ | ロケットの打ち上げに成功して改めてジム戦に挑む決意をするサトシ | |||
| 備考 |
| ◆使用各曲の内訳（重複は除外）。（＊の部分は未収録曲） ※「？？」は劇場版未収録としてカウント）。 ■98年のサントラ収録曲・・・３ ■ＡＧの収録曲・・・１ ■運動会ＣＤの収録曲 （金銀）・・・０ （ＡＧ）・・・１ ■サントラ未収録 （カントー）・・・１＊ （金銀）・・・２＊ （ＡＧ）・・・３＊ ■劇場版 （サントラ収録曲）・・・４ （サントラ未収録）・・・１ 【今回の不明曲】 １の曲、映画の曲かアニメの曲かは不明 |
| AG100話「トクサネジム！ソルロックとルナトーン！」 | ||||||
| 曲順 | 曲名 | カントー | 金銀 | AG | 映画 | シーン等 |
| Aパート | ||||||
| 1 | 結晶塔・未収録 | 未 | 冒頭、ジム戦のルールを聞くサトシ | |||
| 2 | サントラ「ロケット団隠密作戦」 | ★ | ニャースのボス妄想 | |||
| 3 | サントラ「襲撃！」 | ★ | ダブルバトルのジム戦を始めるサトシ達 | |||
| 4 | ミュウツー「乱れ飛ぶモンスターボール」 | ★ | 反撃を開始するサトシ | |||
| 5 | サントラ「なんだかんだと聞かれたら…」 | ★ | サトシ達の前にロケット団登場（メカ登場後） | |||
| 6 | サントラ「絶体絶命」 | ★ | ソルロックとルナトーンを捕まえて逃げるロケット団 | |||
| 7 | 運動会ＣＤ「ルビーサファイア・タイトル」（１回目） | ★ | サトシtがオオスバメにピカチュウを乗せて追わせる | |||
| 8 | ひみつ基地「活躍！」 | ★ | ソルロックとルナトーンのサイコキネシスでロケット団撃退 | |||
| 9 | ルギア・未収録 | 未 | 断崖でジム戦を再開へ | |||
| Bパート | ||||||
| 10 | ＡＧ・未収録〔アクア・マグマ団〕 | 未 | ジム戦再開 | |||
| 11 | ジラーチ「フライゴン登場」 | ★ | 10まんボルトに耐えたオオスバメとピカチュウ | |||
| 12 | ジラーチ・未収録 | 未 | サトシがピカチュウに雷を呼ばせて自分達に落とさせる | |||
| 13 | 水の都「ラティオスの元へ！」 | ★ | 電気をまとって黄金色に輝くオオスバメとピカチュウが、ソルロック達の防御網を突破 | |||
| 14 | 運動会ＣＤ「ルビーサファイア・タイトル」（２回目） | ★ | サトシがジム戦に勝利する | |||
| 15 | サントラ「出会いと別れと」 | ★ | ジムバッジを受け取るサトシ | |||
| 備考 |
| ◆使用各曲の内訳（重複は除外）。（＊の部分は未収録曲） ※「？？」は劇場版未収録としてカウント）。 ■98年のサントラ収録曲・・・５ ■ＡＧの収録曲・・・０ ■運動会ＣＤの収録曲 （金銀）・・・０ （ＡＧ）・・・１ ■サントラ未収録 （カントー）・・・０＊ （金銀）・・・０＊ （ＡＧ）・・・１＊ ■劇場版 （サントラ収録曲）・・・４ （サントラ未収録）・・・３ |